МРТ – один з найефективніших методів діагностики захворювань головного та спинного мозку, хребта, суглобів, органів черевної порожнини (за виключенням шлунку та кишківника) і органів малого тазу, а також серця, судин та молочних залоз. МРТ частіше за все застосовують як метод уточнюючої діагностики.